拥有各类科研机构21个：立足国家、放眼国际、辐射地方、精耕省部、深植行业、服务企业：

国家级（2）：

智能绿色车辆与交通全国重点实验室

中美清洁汽车技术国家级国际联合研究中心

省部级（2）：

“车联网”教育部-中国移动联合实验室

中美电动汽车技术北京市国际科技合作基地

清华大学外派院（1）：

清华大学苏州汽车研究院

清华大学自主批建机构（1）：

清华大学汽车研究所

清华大学跨学科交叉机构（1）：

清华大学智能网联汽车与交通创新中心

清华大学车辆与运载学院自主批建（4）：

清华大学（车辆学院）汽车产业与技术战略研究院

清华大学（车辆学院）汽车发展研究中心

清华大学（车辆学院）飞行汽车动力研究中心

清华大学（车辆学院）智能汽车设计与安全性研究中心

校企联合研究中心（8）：

清华大学-丰田氢能与燃料电池联合研究中心

清华大学-丰田自动驾驶汽车人工智能技术联合研究中心

清华大学-滴滴未来出行联合研究中心

清华大学－一汽解放汽车有限公司智能碳中和车辆科技联合研究中心

清华大学（车辆学院）- 阿利昂斯汽车研发（上海）有限公司智能出行联合研究中心

清华大学（车辆学院）- 壳牌清洁交通能源联合研究中心

清华大学（车辆学院）－纵目科技（上海）股份有限公司智能辅助驾驶系统联合研究中心

清华大学（车辆学院）－广西玉柴机器股份有限公司智慧绿色氢能与动力联合研究中心